结肠息肉按组织学分为：增生性息肉、炎症性息肉、腺瘤性息肉和错构瘤。息肉有良性和恶性之分，大部分的息肉都是良性的，不具备侵犯和播散的能力，也并非所有的息肉都具有癌变倾向。
腺瘤性息肉是肠上皮生长的新生物，有癌变倾向，是由结肠粘膜腺体组成，病理结果可以确定性质，分为管状腺瘤、绒毛状腺瘤、管状—绒毛状腺瘤（又称为混合性腺瘤）。腺瘤性息肉是癌前病变，意思就是说，随着时间的推移，它们会逐步增大，转变成癌。但是，并非所有的腺瘤都会变成癌，由良性的腺瘤转变为恶性肿瘤的过程称为腺瘤癌序列。正常组织转变成癌并非一天或一周完成的，一枚结肠息肉转变为结肠癌，很有可能需要数年的时间。从腺瘤到癌的转变，显微镜下可以观察到结肠细胞的特征性改变，腺瘤性息肉改变的早期阶段称为异型增生，当只有少数细胞改变而大多数细胞正常时，称为轻度异型增生，当绝大部分细胞改变时成为重度异型增生。异型增生是异常改变的第一个迹象，但是这些息肉仍被认为是良性的，因为他们并没有侵入结肠壁，没有转移的能力。局限在粘膜层的重度异性增生被称为原位癌，一旦异常的细胞穿透至粘膜下层，肿瘤变成具有浸润性的癌，意味着它具有侵犯周围和远处组织的能力，变成真正意义上的癌。
息肉的癌变倾向取决于病理类型和大小：息肉越大，越容易恶变；绒毛状腺瘤的癌变机率要高于管状腺瘤。
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